Coupe de France
| 20/08/2011 | 1e Journée | Muret | 0 - 0 | Agen |
| 27/08/2011 | 2e Journée | Agen | 2 - 4 | Marmande |
| 03/09/2011 | 3e Journée | Balma | 2 - 1 | Agen |
| 10/09/2011 | 4e Journée | Agen | 2 - 2 | Montpellier 2 |
| 24/09/2011 | 5e Journée | Nimes 2 | 1 - 0 | Agen |
| 08/10/2011 | 6e Journée | Agen | 2 - 4 | Blagnac |
| 22/10/2011 | 7e Journée | Aurillac | 0 - 1 | Agen |
| 05/11/2011 | 8e Journée | Agen | 0 - 0 | Mérignac |
| 13/11/2011 | 9e Journée | Narbonne | 1 - 1 | Agen |
| 26/11/2011 | 10e Journée | Anglet Genets | 1 - 1 | Agen |
| 03/12/2011 | 11e Journée | Agen | 1 - 2 | Stade Bordelais |
| 17/12/2011 | 12e Journée | Bergerac Foot | 2 - 3 | Agen |
| 14/01/2012 | 13e Journée | Agen | 1 - 2 | Saint-Alban Omnisport |
| 28/01/2012 | 14e Journée | Lormont | 2 - 1 | Agen |
| 18/02/2012 | 17e Journée | Agen | 3 - 2 | Balma |
| 25/02/2012 | 15e Journée | Agen | 0 - 1 | Toulouse 2 |
| 04/03/2012 | 18e Journée | Montpellier 2 | 3 - 0 | Agen |
| 10/03/2012 | 19e Journée | Agen | 1 - 1 | Nimes 2 |
| 17/03/2012 | 20e Journée | Blagnac | 0 - 1 | Agen |
| 24/03/2012 | 21e Journée | Agen | 1 - 0 | Aurillac |
| 31/03/2012 | 22e Journée | Mérignac | 0 - 0 | Agen |
| 07/04/2012 | 16e Journée | Marmande | 0 - 3 | Agen |
| 14/04/2012 | 23e Journée | Agen | 0 - 1 | Narbonne |
| 21/04/2012 | 24e Journée | Agen | 1 - 3 | Anglet Genets |
| 28/04/2012 | 25e Journée | Stade Bordelais | 3 - 0 | Agen |
| 04/05/2012 | 26e Journée | Agen | 1 - 0 | Bergerac Foot |
| 12/05/2012 | 27e Journée | Saint-Alban Omnisport | 0 - 0 | Agen |
| 19/05/2012 | 28e Journée | Agen | 3 - 0 | Lormont |
| 26/05/2012 | 29e Journée | Toulouse 2 | 3 - 1 | Agen |
| 02/06/2012 | 30e Journée | Agen | 18:00 | Muret |
